GeneLoc Home GeneCards Home MalaCards Home About GeneLoc Contact Us
Display genomic neighborhood for:
genomic entity (gene/enhancer/marker)
genomic coordinates

  Chromosome 11

   GeneLoc map region (34,510,400 - 38,593,156 bp) around gene/enhancer/marker "RAG1"

   Explanation:
   RAG1 is located at 36,510,400-36,593,156 bp

#
#
Start (bp)
Start (bp)
End (bp)
End (bp)
Strand
Strand
Gene
Gene
Enhancer ID
Enhancer ID
Unigene cluster
Unigene cluster
Entrez Gene Id
Entrez Gene Id
Ensembl Id
Ensembl Id
Description
Description
134478793 34513805 - ELF5
Exon structure

Hs.11713 2001 ENSG00000135374 E74 like ETS transcription factor 5
234512954 34513123

GH11E034512



334513414 34514347

GH11E034513



434533014 34557924 - ENSG00000255271
Exon structure



ENSG00000255271
534564074 34565314

GH11E034564



634565554 34565703

GH11E034565



734570694 34570823

GH11E034570



834570876 34578608 + LOC105376623
Exon structure


105376623 ENSG00000255427
934573951 34593915 + GC11P034573




1034575023 34594451 + GC11P034575




1134584824 34587595

GH11E034584



1234587601 34588263

GH11E034587



1334598848 34605061

GH11E034598



1434605601 34606400

GH11E034605



1534610000 34610201

GH11E034610



1634613002 34615199

GH11E034613



1734619114 34619263

GH11E034621



1834619322 34619963

GH11E034619



1934620001 34622524

GH11E034620



2034621041 34663288 + EHF
Exon structure

Hs.653859 26298 ENSG00000135373 ETS homologous factor
2134622602 34622799

GH11E034622



2234622885 34625104

GH11E034623



2334626008 34628015

GH11E034626



2434630536 34636122

GH11E034630



2534638284 34648036

GH11E034638



2634649802 34656555

GH11E034649



2734668254 34668443

GH11E034668



2834674223 34710264 + NDUFB8P3
Exon structure


100132286
NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B8 pseudogene 3
2934680309 34682185

GH11E034680



3034683947 34686540

GH11E034683



3134685631 34703563 + GC11P034685




3234692141 34692799

GH11E034692



3334692784 34877212 + LOC102723568
Exon structure


102723568

3434693002 34693399

GH11E034693



3534709600 34710161 + ENSG00000271369
Exon structure



ENSG00000271369
3634742906 34743199 + ENSG00000270491
Exon structure



ENSG00000270491
3734749877 34751115

GH11E034749



3834757094 34757363

GH11E034757



3934781057 34784833 + GC11P034781




4034791850 34791879 - PIR36408
Exon structure





4134792325 34792701

GH11E034792



4234792814 34793063

GH11E034793



4334793673 34794360 - GC11M034793




4434805942 34806287

GH11E034805



4534808682 34810827

GH11E034808



4634813373 34814968 - GC11M034814




4734824449 34827402

GH11E034824



4834824571 34825834 - LOC105376625
Exon structure


105376625

4934850474 34850563

GH11E034850



5034853094 34916499 - APIP
Exon structure

Hs.447794 51074 ENSG00000149089 APAF1 interacting protein
5134853602 34875283 - LOC105376624
Exon structure


105376624

5234854223 34855905

GH11E034854



5334856839 34864657 - GC11M034856




5434882741 34894935 - GC11M034882




5534898297 34898676

GH11E034898



5634899154 34899303

GH11E034899



5734908296 34911843

GH11E034908



5834914589 34919101

GH11E034914



5934915829 35020591 + PDHX
Exon structure

Hs.502315 8050 ENSG00000110435 pyruvate dehydrogenase complex component X
6034924201 34924600

GH11E034924



6134926002 34927399

GH11E034926



6234928524 34931308

GH11E034928



6334941837 34941920 + MIR1343
Exon structure


100616437 ENSG00000251862 microRNA 1343
6434943694 34943843

GH11E034943



6534972034 34972183

GH11E034972



6634972282 34972717

GH11E034974



6734973014 34973223

GH11E034973



6834975220 34979645

GH11E034975



6934975355 34980815 + GC11P034975




7034988176 34989643

GH11E034988



7134996706 34999003

GH11E034996



7234999401 34999800

GH11E034999



7335003601 35003800

GH11E035003



7435005474 35005643

GH11E035005



7535005714 35005863

GH11E035007



7635005909 35015703

GH11E035006



7735009347 35012360 - GC11M035009




7835023691 35024668 - GC11M035023




7935029515 35034438

GH11E035029



8035035202 35051674

GH11E035035



8135050136 35067254 - LOC105376626
Exon structure


105376626

8235053213 35053547

GH11E035053



8335056302 35060200

GH11E035056



8435063281 35064903

GH11E035063



8535065401 35068000

GH11E035065



8635069633 35070502

GH11E035069



8735073800 35074001

GH11E035073



8835076142 35080999

GH11E035076



8935081602 35090003

GH11E035081



9035081656 35082075 + GC11P035081




9135086800 35097559 + LOC105376627
Exon structure


105376627

9235098048 35101087

GH11E035098



9335103188 35103444 + GC11P035103




9435103914 35104063

GH11E035103



9535105402 35113460

GH11E035105



9635111074 35111380 + GC11P035111




9735114802 35118107

GH11E035114



9835118663 35119506

GH11E035118



9935122036 35122995

GH11E035122



10035125898 35127094

GH11E035125



10135132650 35138032 - LOC100507144
Exon structure

Hs.673491 100507144 ENSG00000255521 Uncharacterized LOC100507144 (est)
10235134794 35135215

GH11E035134



10335137342 35147789

GH11E035137



10435138870 35232402 + CD44
Exon structure

Hs.502328 960 ENSG00000026508 CD44 molecule (Indian blood group)
10535148075 35148865

GH11E035148



10635151046 35153699

GH11E035151



10735156601 35157000

GH11E035156



10835157512 35181589

GH11E035157



10935182114 35183065

GH11E035182



11035183437 35183790

GH11E035183



11135187294 35187443

GH11E035187



11235189764 35193286

GH11E035189



11335210054 35210181 + GC11P035210




11435210343 35214985 - ENSG00000255443
Exon structure



ENSG00000255443
11535211401 35220459

GH11E035211



11635212550 35214007 + ENSG00000251194
Exon structure



ENSG00000251194
11735222367 35224585

GH11E035222



11835226756 35228916

GH11E035226



11935232594 35233885

GH11E035232



12035235002 35239199

GH11E035235



12135239611 35239646

GH11E035239



12235241950 35243519

GH11E035241



12335245753 35248938

GH11E035245



12435251205 35420063 - SLC1A2
Exon structure

Hs.502338 6506 ENSG00000110436 solute carrier family 1 member 2
12535256307 35258199

GH11E035256



12635260204 35261441

GH11E035260



12735265572 35266843

GH11E035265



12835267040 35267353

GH11E035267



12935267594 35267763

GH11E035268



13035272002 35273770

GH11E035272



13135274776 35277616

GH11E035274



13235280696 35283149

GH11E035280



13335281813 35286009 + ENSG00000255004
Exon structure



ENSG00000255004
13435288323 35290603

GH11E035288



13535291001 35291200

GH11E035291



13635293409 35293503

GH11E035293



13735294542 35298139

GH11E035294



13835302546 35306250

GH11E035302



13935307270 35307719

GH11E035308



14035307979 35308566

GH11E035307



14135311201 35313000

GH11E035311



14235313023 35314399

GH11E035313



14335318601 35319801

GH11E035318



14435320628 35320663

GH11E035320



14535321153 35323876

GH11E035321



14635324038 35324411

GH11E035324



14735324952 35325714

GH11E035325



14835325998 35327650

GH11E035326



14935329801 35332400

GH11E035329



15035332674 35332823

GH11E035332



15135334114 35335289

GH11E035334



15235336385 35339300

GH11E035336



15335339401 35339600

GH11E035339



15435340001 35340400

GH11E035340



15535342687 35343800

GH11E035342



15635344201 35349800

GH11E035344



15735351249 35352801

GH11E035351



15835354753 35355211

GH11E035354



15935357716 35360870

GH11E035357



16035362069 35368333

GH11E035362



16135373201 35373843

GH11E035373



16235373856 35374261

GH11E035374



16335374265 35374474 + ENSG00000215380
Exon structure



ENSG00000215380
16435376814 35376903

GH11E035376



16535387305 35388305

GH11E035387



16635389214 35389363

GH11E035390



16735389480 35392963

GH11E035389



16835393174 35393323

GH11E035393



16935401094 35401243

GH11E035401



17035401776 35405109

GH11E035402



17135411591 35414040 + GC11P035411




17235412099 35414309 - GC11M035412




17335419057 35421002 + ENSG00000255542
Exon structure



ENSG00000255542
17435419474 35419503

GH11E035419



17535421837 35422227

GH11E035421



17635423921 35425118

GH11E035423



17735426258 35426662

GH11E035426



17835431823 35530300 - PAMR1
Exon structure

Hs.55044 25891 ENSG00000149090 peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1
17935477801 35478400

GH11E035477



18035482901 35485111

GH11E035482



18135485605 35485794

GH11E035486



18235485813 35485962

GH11E035485



18335487653 35487822

GH11E035487



18435490436 35492947

GH11E035490



18535506114 35506447

GH11E035506



18635510888 35512734

GH11E035510



18735513677 35516253

GH11E035513



18835523051 35526460

GH11E035523



18935526533 35526702

GH11E035526



19035529443 35531948

GH11E035529



19135539146 35543090

GH11E035539



19235548851 35551029

GH11E035548



19335553669 35555882

GH11E035553



19435558133 35559553

GH11E035558



19535563122 35564368

GH11E035563



19635566996 35568877

GH11E035566



19735579402 35585046

GH11E035579



19835579430 35585310 - ENSG00000254669
Exon structure



ENSG00000254669
19935579890 35583773 + GC11P035579




20035587963 35589721

GH11E035587



20135592793 35593506

GH11E035592



20235597642 35805427 - GC11M035597




20335598693 35598842

GH11E035598



20435602042 35602892

GH11E035602



20535605489 35606442

GH11E035605



20635616313 35616442

GH11E035616



20735616601 35617000

GH11E035618



20835617378 35624710

GH11E035617



20935618187 35620873 + FJX1
Exon structure

Hs.39384 24147 ENSG00000179431 four jointed box 1
21035629283 35631076

GH11E035629



21135641219 35641962

GH11E035641



21235656694 35661339 + ENSG00000254686
Exon structure



ENSG00000254686
21335661636 35664172

GH11E035661



21435662692 35818007 + TRIM44
Exon structure

Hs.192103 54765 ENSG00000166326 tripartite motif containing 44
21535671601 35671800

GH11E035671



21635675401 35676801

GH11E035675



21735681502 35683799

GH11E035681



21835684000 35684400

GH11E035684



21935715033 35715222

GH11E035715



22035721573 35722986

GH11E035721



22135734330 35736843

GH11E035734



22235749633 35752800

GH11E035749



22335761801 35762600

GH11E035761



22435781201 35781601

GH11E035781



22535785201 35789359

GH11E035785



22635794153 35799314

GH11E035794



22735800601 35801400

GH11E035800



22835802296 35802484

GH11E035802



22935803983 35804064

GH11E035803



23035810515 35810932

GH11E035810



23135811696 35812368

GH11E035811



23235812931 35813080

GH11E035812



23335814332 35818007 + GC11P035814




23435815646 35817030

GH11E035815



23535816336 35816364 + PIR35060
Exon structure





23635821391 35822860

GH11E035821



23735824184 35824211 + PIR45735
Exon structure





23835851801 35852600

GH11E035851



23935859269 35859585

GH11E035859



24035860185 35861585 - KRT18P14
Exon structure


119722 ENSG00000186082 keratin 18 pseudogene 14
24135890637 35891850

GH11E035890



24235893177 35894924

GH11E035893



24335907715 35909464

GH11E035907



24435915051 35918739 - ENSG00000254919
Exon structure



ENSG00000254919
24535918982 35919800

GH11E035918



24635926994 35928517

GH11E035926



24735932201 35933599

GH11E035932



24835943346 35945739

GH11E035943



24935943981 36232136 + LDLRAD3
Exon structure

Hs.745134 143458 ENSG00000179241 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3
25035949001 35949200

GH11E035949



25135953385 35953880

GH11E035953



25235967010 35968676 - LOC100420018
Exon structure


100420018 ENSG00000254672
25335969103 35969920

GH11E035969



25435972428 35989007 + ENSG00000255256
Exon structure



ENSG00000255256
25535974539 35975898

GH11E035974



25635979857 35982800

GH11E035979



25735997148 35997766 - RPL12P31
Exon structure


100271406 ENSG00000241228 ribosomal protein L12 pseudogene 31
25835997226 35997675 - GC11M035997




25936001850 36003641

GH11E036001



26036007497 36007520

GH11E036007



26136007525 36010829

GH11E036008



26236010098 36010204 + MIR3973
Exon structure


100616311 ENSG00000263389 microRNA 3973
26336011921 36013240

GH11E036011



26436014001 36016720

GH11E036014



26536019195 36020602

GH11E036019



26636020636 36034018 - GC11M036020




26736023696 36025480

GH11E036023



26836030201 36032013

GH11E036030



26936033025 36035872

GH11E036033



27036037171 36037177

GH11E036037



27136048551 36049640

GH11E036048



27236056411 36058516

GH11E036056



27336061200 36061400

GH11E036061



27436063131 36063280

GH11E036063



27536063283 36078277 - LOC101928510
Exon structure


101928510

27636069597 36071351

GH11E036069



27736072317 36076209

GH11E036072



27836090401 36093247

GH11E036090



27936095791 36095840

GH11E036095



28036103906 36106948

GH11E036103



28136108405 36112610

GH11E036108



28236115493 36115978

GH11E036115



28336123201 36124020

GH11E036123



28436130600 36130801

GH11E036130



28536131814 36132566

GH11E036131



28636134403 36134431 + PIR54286
Exon structure





28736146089 36147082

GH11E036146



28836148536 36151799

GH11E036148



28936149155 36149182 + PIR39980
Exon structure





29036153401 36153600

GH11E036153



29136153691 36153754

GH11E036155



29236154718 36157817

GH11E036154



29336161414 36173216 - GC11M036161




29436162331 36163469

GH11E036162



29536164201 36164800

GH11E036164



29636165591 36165756

GH11E036165



29736182322 36182507

GH11E036182



29836185809 36186833

GH11E036185



29936193468 36193496 + PIR46476
Exon structure





30036195538 36197050

GH11E036195



30136196248 36197901 + ENSG00000280321
Exon structure



ENSG00000280321
30236200536 36201976 - GC11M036200




30336203300 36203326 - PIR45055
Exon structure





30436212541 36216935

GH11E036212



30536214771 36214797 + PIR40336
Exon structure





30636231001 36231200

GH11E036232



30736231371 36231540

GH11E036231



30836246488 36250148 - GC11M036246




30936249001 36249751

GH11E036249



31036257401 36257600

GH11E036257



31136266111 36266280

GH11E036266



31236269284 36289449 - COMMD9
Exon structure

Hs.279836 29099 ENSG00000110442 COMM domain containing 9
31336278860 36279070

GH11E036278



31436283320 36283453

GH11E036283



31536288479 36290060

GH11E036288



31636292411 36292560

GH11E036293



31736292600 36292800

GH11E036292



31836296175 36465204 + PRR5L
Exon structure

Hs.19987 79899 ENSG00000135362 proline rich 5 like
31936296485 36298108

GH11E036296



32036300587 36300921

GH11E036300



32136308711 36308840

GH11E036308



32236309653 36309986

GH11E036309



32336312229 36313400

GH11E036312



32436321158 36323440 - ENSG00000254566
Exon structure



ENSG00000254566
32536326775 36327920

GH11E036326



32636328624 36330674

GH11E036328



32736344525 36347592

GH11E036344



32836349420 36350400

GH11E036349



32936353031 36353180

GH11E036353



33036354201 36355001

GH11E036354



33136355601 36357400

GH11E036355



33236356925 36356952 + PIR61917
Exon structure





33336360002 36365025

GH11E036360



33436365801 36366001

GH11E036365



33536370935 36374381

GH11E036370



33636375531 36375680

GH11E036376



33736375858 36381434

GH11E036375



33836377524 36379209 + GC11P036377




33936384772 36386069

GH11E036384



34036386521 36388250 + ENSG00000255186
Exon structure



ENSG00000255186
34136387601 36388200

GH11E036387



34236390001 36391800

GH11E036390



34336392601 36392800

GH11E036392



34436394211 36394340

GH11E036394



34536398324 36401800

GH11E036398



34636402594 36404417

GH11E036402



34736404583 36404717

GH11E036404



34836407002 36413618

GH11E036407



34936419867 36423167

GH11E036419



35036425447 36426122 - ENSG00000255060
Exon structure



ENSG00000255060
35136425461 36427400

GH11E036425



35236430768 36433316

GH11E036430



35336439806 36444614 + GC11P036439




35436448071 36448237

GH11E036448



35536449801 36450999

GH11E036449



35636451652 36457183

GH11E036451



35736469060 36471074

GH11E036469



35836478831 36479000

GH11E036478



35936483767 36510313 - TRAF6
Exon structure

Hs.444172 7189 ENSG00000175104 TNF receptor associated factor 6
36036483773 36487445 - GC11M036483




36136487164 36488983

GH11E036487



36236492831 36493000

GH11E036492



36336493091 36493202

GH11E036493



36436499280 36503812

GH11E036499



36536507872 36513056

GH11E036507



36636510360 36510537 + GC11P036511




36736510360 36510537 + GC11P036512




36836510361 36510537 + ENSG00000280331
Exon structure



ENSG00000280331
36936510400 36593156 + RAG1
Exon structure

Hs.73958; Hs.677010 5896 ENSG00000166349 recombination activating 1
37036533001 36533400

GH11E036533



37136541000 36541401

GH11E036541



37236546050 36546547 - GC11M036546




37336554328 36554446 + GC11P036554




37436555360 36557771 + GC11P036555




37536557031 36557399

GH11E036557



37636558180 36560450

GH11E036558



37736564402 36565000

GH11E036564



37836566601 36566800

GH11E036566



37936569122 36569460

GH11E036569



38036571933 36572368

GH11E036571



38136575574 36598279 - RAG2
Exon structure

Hs.714519 5897 ENSG00000175097 recombination activating 2
38236577137 36578490

GH11E036577



38336593847 36595773

GH11E036593



38436594229 36659291 + C11orf74
Exon structure

Hs.159376 119710 ENSG00000166352 chromosome 11 open reading frame 74
38536596326 36596713

GH11E036596



38636597326 36605480 - GC11M036597




38736600201 36600600

GH11E036600



38836601001 36601800

GH11E036601



38936618201 36619799

GH11E036618



39036626493 36628903

GH11E036626



39136638981 36639269

GH11E036638



39236644578 36655239 - GC11M036644




39336657112 36657213

GH11E036657



39436666678 36677720 + GC11P036666




39536683969 36684121

GH11E036683



39636684931 36685080

GH11E036684



39736685228 36685502

GH11E036685



39836696317 36697867 + LOC100422241
Exon structure


100422241 ENSG00000254498
39936702711 36702860

GH11E036702



40036709049 36710990 - LOC105376631
Exon structure


105376631

40136709353 36709385

GH11E036709



40236724801 36725399

GH11E036724



40336725580 36732204 + GC11P036725




40436743480 36744644

GH11E036743



40536744671 36744820

GH11E036744



40636747191 36747340

GH11E036747



40736751247 36751982

GH11E036751



40836774166 36775625

GH11E036774



40936775891 36776040

GH11E036775



41036777391 36777540

GH11E036777



41136790151 36790869

GH11E036790



41236793131 36793852

GH11E036793



41336810666 36813503 + GC11P036810




41436832762 36833884 + GC11P036832




41536976701 36977078

GH11E036976



41636989416 37032400 - GC11M036989




41737036760 37037972 - GC11M037036




41837086356 37090714 - GC11M037086




41937161340 37180189 - GC11M037161




42037199108 37220581 + GC11P037199




42137199260 37201355 - GC11M037199




42237212462 37216686 - GC11M037212




42337321011 37321160

GH11E037321



42437407788 37416394 + GC11P037407




42537434288 37468484 + GC11P037434




42637450402 37454299

GH11E037450



42737465148 37469520 - GC11M037465




42837471812 37489050 - LOC105376632
Exon structure


105376632

42937476138 37476415

GH11E037476



43037499737 37501524

GH11E037499



43137501801 37506861

GH11E037501



43237510492 37512520

GH11E037510



43337557969 37559631

GH11E037557



43437560471 37560620

GH11E037560



43537630720 37631651

GH11E037630



43637642087 37643183

GH11E037642



43737643490 37643752

GH11E037643



43837702125 37702220 - ENSG00000251838
Exon structure



ENSG00000251838
43937725645 37726490 + RPL7AP56
Exon structure


100271536 ENSG00000242834 ribosomal protein L7a pseudogene 56
44037725666 37726456 + GC11P037725




44137785963 37789602

GH11E037785



44237859231 37859380

GH11E037859



44337891514 37896250 + GC11P037891




44437938601 37954663 + LOC105376633
Exon structure


105376633 ENSG00000254516
44537946291 37946400

GH11E037946



44637956950 37957173

GH11E037956



44737988089 37988303

GH11E037988



44838013510 38014141 - ENSG00000279004
Exon structure



ENSG00000279004
44938019491 38019640

GH11E038019



45038046231 38047513

GH11E038046



45138089791 38089940

GH11E038089



45238090031 38090180

GH11E038090



45338152691 38152840

GH11E038152



45438200942 38337044 - LOC105376634
Exon structure


105376634

45538211389 38212799 + LRRC6P1
Exon structure


100420589 ENSG00000254784 leucine rich repeat containing 6 pseudogene 1
45638255856 38315122 + GC11P038255




45738255959 38257200

GH11E038255



45838415094 38499745 + GC11P038415




45938460428 38462416

GH11E038460



46038472584 38473142 - GC11M038472




46138498995 38500186 + ENSG00000255477
Exon structure



ENSG00000255477
46238538822 38539296

GH11E038538